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M20单细胞测序
M20 Spatial 基于随机引物的全样本空间全转录组技术
基于随机引物的技术优势,M20 Spatial在应用物种、样本保存类型、捕获RNA种类及全长序列无偏覆盖等方面实现了创新突破 , 将有助于提高空间转录组技术在科研及临床多领域中的应用价值,并且更大拓宽空间转录组研究带来的信息与视野,从而进一步助力生物医药领域获取更多前沿突破。
核心技术路线及原理
Core Technology Roadmap and Principles
技术优势
Technological Advantages
全样本类型
不仅可用于新鲜样本、冻存样本, 还适用于FFPE样本
全转录组
可对全转录组进行无偏好的捕获,因此可实现对非编码RNA(如lncRNA)的研究
全长序列
实现对转录组全长序列的捕获,从而获得全长转录组的完整信息,在空间组层面实现对基因融合、可变剪切等信息的深入挖掘
实测数据
样本类型:小鼠脑FFPE样本
- 获取高精度的空间转录组信息
在3,190个位点中,测得的总基因数为29,380,每位点中值基因数为3,449
- 识别细胞亚群异质性
对于像脑这样较为复杂、不同区域细胞类型区别较大的器官,M20 Spatial的分群数据能直接体现出不同脑区的空间组织
- 无偏捕获全长转录本
M20 Spatial实现了空间转录组数据从5’到3’均一覆盖,获得的转录组信息更加真实可靠
- 解析空间lncRNA信息
M20 Spatial在小鼠FFPE样本中检测lncRNA占到总检出RNA的2%-10%,使空间转录组提供的信息更加深入和全面
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