产品简介
VITA平台采用具有自主知识产权、基于随机引物策略的M20 Seq方法,可以实现全样本类型、全物种、全长单细胞转录组研究,并且大幅度提高了单细胞测序的基因检出数,将极大拓宽单细胞技术的应用领域。
基于微流控技术的全自动单细胞捕获与文库制备系统。17分钟内完成上万个细胞的封装,细胞捕获效率高,双胞率低。支持标准通量(1000~20000个细胞)和超高通量(最高百万)两种工作模式。
包含单细胞捕获、逆转录、扩增和建库所需的全套耗材与反应试剂。采用自主研发的随机引物体系,突破polyA限制,实现对各类RNA(含lncRNA、降解RNA)的全长检测。
集成数据质控、细胞聚类、差异分析、细胞轨迹推断、细胞互作分析等核心功能,输出可视化报告。兼容Seurat、Scanpy等主流生信分析框架,可与现有分析流程无缝整合。
平台性能
RNA 5'至3'全长覆盖度
突破性地实现单细胞转录组全长序列测序,从5'至3'均匀覆盖,彻底消除3'端偏好,lncRNA检测更全面。
lncRNA检测
可在单细胞层面研究lncRNA的调控作用,lncRNA占所有检测转录本的比例达10%左右,远超传统方法。
双胞率
5000个细胞时双胞率 < 2%,确保单细胞数据的纯净性,减少数据分析中的噪音干扰。
高敏感性
相较polyA方法,单细胞水平基因检出数大幅提升,在整体基因检出数上也具有明显优势,稀有基因更易被捕获。
适用物种
动物:人、小鼠、大鼠、爪蟾、斑马鱼、果蝇等;植物:水稻、拟南芥等;微生物:真菌、细菌、原虫等。
样本类型
细胞悬液、新鲜组织、冻存组织、石蜡包埋样本、福尔马林固定组织、细菌悬液及微生物组样本等全类型兼容。
捕获细胞数
标准通量:1000~20000个细胞;超高通量模式:最高可达百万个细胞,满足大规模组织图谱研究需求。
测序平台兼容
完全兼容Illumina测序平台(HiSeq/NovaSeq系列)及华大BGI测序平台(DNBSEQ系列),灵活选择。
技术原理
M20 Seq技术的核心创新在于采用随机引物策略取代传统的polyA捕获策略。传统单细胞测序(如10X Genomics)依赖细胞内mRNA的polyA尾进行捕获,因此只能检测有polyA结构的真核mRNA,且多从3'端测序,难以获得全长序列信息。
随机引物体系
M20 Seq设计了一套具有自主知识产权的随机引物体系,该引物可与任意RNA序列结合,不依赖polyA结构。这使得系统能够检测:
- 全长mRNA(从5'帽至3'polyA尾)
- lncRNA(长链非编码RNA)
- 降解RNA片段(适用于FFPE等低质量样本)
- 原核生物mRNA(无polyA结构)
微流控单细胞封装
VITAcruizer® 仪器利用微流控技术,将单个细胞与带有细胞条形码(Cell Barcode)的凝胶珠共同封装在纳升级油包水液滴中,实现高通量单细胞并行反应,确保每个细胞的转录组信息被独立标记。
全长转录组重建
通过逆转录、扩增、建库等步骤,获得包含细胞条形码、UMI分子标签和全长cDNA序列的文库,经测序后可精确重建每个细胞的全长转录组图谱。